Problem yang sering terjadi pada Reverse Osmosis adalah munculnya micro fouling akibat dari aktivitas bakteri dan penyumbatan kerak mineral pada membran reverse osmosis. Oleh karena itu membutuhkan treatment khusus dengan beberapa chemical yang tepat diantara nya :

1. Antiscalant
2. Biocide
3. Chlorine Scavanger
4. Cleaning Agent